Το Παθολογοανατομικό Εργαστήριο του Νοσοκομείου ιδρύθηκε το 1970. Με την υπαγωγή του νοσοκομείου στο ΕΣΥ εντάχθηκε και αυτό στο ΕΣΥ και λειτουργεί από το 1985 ως πλήρες τμήμα στελεχωμένο με πέντε ειδικευμένους ιατρούς. Διευθυντής του εργαστηρίου είναι ο/η -/-/-/-/-/-/-, Αναπληρώτριες Διευθύντριες οι κ.κ. Σ. Λεγάκη και Μ. Δαιμονάκου, Επιμελήτρια Α΄,η κ. Σ Ζούγρη και Επιμελήτρια Β΄κ. Μ. Χόρτη.

Το εργαστήριο διαθέτει δύο θέσεις ειδικευομένων ιατρών χορηγώντας πλήρη ειδικότητα.

Ετησίως εκτελεί περίπου 6.000 εξετάσεις στις οποίες περιλαμβάνονται Χειρουργικά Παρασκευάσματα, Βιοψίες, Βιοψίες δια λεπτής βελόνης και Συμβουλευτικές Γνώμες, με αντικείμενο τη Γενική Παθολογική Ανατομική και με εξειδικευμένους τους ακόλουθους τομείς:

Ουροποιητικό: Υπεύθυνος Ν. Ταμβάκης
Αναπνευστικό:Υπεύθυνη Σ. Λεγάκη
Πεπτικό και Ηπαρ:Υπεύθυνη Μ. Δαιμονάκου.

Εκτελούνται όλες οι ιστοχημικές χρώσεις και εφαρμόζονται όλες οι τεχνικές της ανοσοιστοχημείας σε ανοικτό αυτόματο σύστημα για μεγάλη ποικιλία αντιγόνων, από πέντε έμπειρους τεχνολόγους.