Το Κυτταρολογικό Εργαστήριο ανήκει στον Εργαστηριακό Τομέα. Στελεχώνεται από 5 ειδικευόμενους ιατρούς, 2 ειδικευόμενους και 3 τεχνολόγους. Το διαγνωστικό εύρος του τμήματος περιλαμβάνει τα κάτωθι υλικά:

1. Βρογχοσκοπήσεις (βρογχικές εκκρίσεις ,ψήκτρες,ΤΒΝΑ)
2. Βρογχοκυψελιδικό έκπλυμα (lavage)
3. Πτύελα
4. Πλευρικικά,ασκιτικά,περικαρδιακά κ.λ.π.υγρά σωματικών κοιλοτήτων
5. Ούρα
6. Παρακεντήσεις δια λεπτής βελόνας(FNA):
   • Θυρεοειδούς
   • Μαστού
   • Λεμφαδένων
   • Σιελογόνων αδένων
   • Δερματικών οζιδίων
7. Pap-test